Ser reconocida como institución de estudios superiores que responde a las demandas del contexto socioeconómico nacional e internacional, que se caracteriza por una gestión estratégica innovadora y participativa liderada por personas comprometidas en el mejoramiento de la eficacia y la eficiencia, logrando así la efectividad. La FaCAF aspira a formar profesionales poseedores de valores sociales e individuales, con una sólida y actualizada formación teórico-práctica, tanto en lo científico como en lo tecnológico, que se distingan por su liderazgo, su espíritu innovador, su creatividad, su visión prospectiva, así como su iniciativa para proyectar, desarrollar y evaluar estrategias que permitan, a través del trabajo creador, mejorar su nivel de calidad de vida y de quienes le rodean.
La misión educacional de la FaCAF definida en el contexto de los valores que sustentan los fines de la educación paraguaya, dedicándose a la docencia a nivel superior, la investigación y la extensión en el área de las Ciencias Agropecuarias y Forestales a los fines de contribuir con el incremento y la difusión de los saberes propios de la disciplina que las conforman.
Preparar profesionales dirigidos a lograr la eficiencia productiva en el sector agropecuario con métodos y técnicas acordes del avance de la ciencia y la tecnología, en armonía con el ambiente y respeto a la sociedad del consumo, mediante la investigación convergente a la especialización agrícola y pecuaria.
